Таксонометрические категории. Группы прокариот по определению бактерий Берги.

Основная категория биологической систематики — вид. Каждый вид (например, Человек разумный — Homosapiens ) имеет двойное латинское название, состоящее из родового и видового имён. Родовое имя пишется с заглавной буквы, видовое — со строчной.

Кроме основной категории — вида — существуют более мелкие, внутривидовые категории (подвид, разновидность) и более крупные — род, семейство, класс, тип и т. д.

Основные таксономические категории следующие:

-царство ( regnum )

-тип ( phylum )

-подтип ( subphylum )

-класс ( classis )

-подкласс (subclassis)

-отряд (у растений — порядок) ( ordo )

-подотряд ( subordo )

-семейство ( familia )

-подсемейство ( subfamilia )

-род ( genus )

-подрод( subgenus )

-вид ( species )

-подвид ( subspecies )

-разновидность ( varietas )

-форма ( forma )

В IX издании Определителя бактерий Берги впервые сделана попытка классифицировать известные архебактерии. Они разделены на 5 подгрупп.

 В I, самую большую, подгруппу включены  метаногенные бактерии , главным и характерным признаком которых является способность образовывать метан в качестве конечного продукта энергетического метаболизма.

 Во II подгруппу отнесены экстремально  термофильные , строго  анаэробные формы, образующие H2S из сульфата в процессе диссимиляционнойсульфатредукции.

 Экстремально  галофильные архебактерии, составляющие III подгруппу, представлены грамположительными или грамотрицательными формами,  аэробными или  факультативно анаэробными  хемоорганотрофами . Характерна потребность в высоких концентрациях NaCl. Некоторые виды содержат бактериородопсин и способны использовать энергию света для синтеза  АТФ . В природе распространены в местах с высокой концентрацией соли: в соленых озерах, белковых продуктах, законсервированных с помощью соли, например в соленой рыбе.

 IV группа представлена архебактериями без клеточной стенки. В ее составе один род  Thermoplasma , вид  Тhermoplasmaacidophilum .

 К V подгруппе отнесены архебактерии, характеризующиеся совокупностью следующих признаков:  облигатные  термофилы ;  ацидофилы или  нейтрофилы ; аэробы, факультативные или строгие анаэробы;  автотрофы или  гетеротрофы . Метаболизм большинства из них связан с молекулярной серой (S0). Представители порядка  Thermoproteales в процессе  хемолитоавтотрофного роста получают энергию в реакции:

 Н2 + S0 = H2S.

 При использовании органических субстратов S0 служит конечным акцептором электронов, конечные продукты энергетического метаболизма - СО2 и H2S.

 Представители порядка  Sulfolobales могут в аэробных условиях окислять H2S до S0 и далее до SO4--, а в анаэробных - восстанавливать S0 до H2S с участием Н2.

Отдел I. GracilicutesВключает организмы с разной морфологией, имеющие грамотрицательную клеточную стенку. Размножение в основном бинарным делением, в некоторых группах - почкованием, в одной - множественным делением. Спор не образуют. Многие подвижны: с помощью жгутиков или скольжения. Аэробные, аназробные или факультативно аназробные формы. Отдел подразделяется на 3 класса, объединяющие нефотосинтезирующие (Scotobacteria) и фотосинтезирующие (Anoxyphotobacteria, Oxyphotobacteria)

Отдел II. Firmicutes  Входят организмы с грамположительной клеточной стенкой. Размножаются в основном бинарным делением. Некоторые образуют зндоспоры. У других споры на гифах или в спорангиях. Перемещаются с помощью жгутиков. Большинство неподвижны. В состав отдела входят азробные, анаэробные, факультативно анаэробные формы. В зависимости от морфологии предложено деление на 2 класса: Firmibacteria (кокки, палочки, неветвящиеся нити) и Thallobacteria (ветвящиеся формы)

Отдел III. Tenericutes  Относятся прокариоты, у которых отсутствует клеточная стенка и не синтезируются предшественники пептидогликана. Клетки окружены ЦПМ, чрезвычайно плеоморфны. Размножение бинарным делением, почкованием, фрагментацией. Окрашивание по Граму отрицательное. Характерно образование мелких, врастающих в агар колоний. Могут быть сапрофитами, паразитами или патогенами. Представлены одним классом Mollicutes

Отдел IV. Mendosicutes – имеют один класс Archaebacteria, куда входят древние формы, вроде метанобразующих. Объединены прокариоты, по имеющимся данным, претендующие на более раннее происхождение, чем формы, включенные в 1 и 11 отделы. Клетки разной формы: кокки, палочки, нити. Многие плеоморфны. Большинство имеют клеточную стенку, но она не содержит типичногопептидогликана. Клеточная стенка может быть построена только из белковых макромолекул или гетерополисахаридов. Окрашивание по Граму отрицательное или положительное. Большинство - строгиеаназробы. Многие имеют жгутики. Характеризуются экологическим и метаболическим разнообразием, способностью жить в экстремальных условиях. Объединены в класс Archaeobacteria

Термины образованы от следующих латинских слов: cutes - кожа; gracilis - тонкий; firmus - крепкий, прочный; tener - мягкий, нежный; mendosus - ошибочный.