Векторные системы, применяемые для клонирования в клетках прокариотических организмов

 Векторами называют молекулы ДНК, способные переносить и стабильно поддерживать в реципиентных клетках чужеродную генетическую информацию. В настоящее время описано чрезвычайно много плазмид стрептомицет, отличающихся по своим свойствам: высоко и низкокопийные, транс и нетрансмиссибельные, криптические и лекарственной устойчивости и т. д.Среди мультикопийных векторов предпочтение отдают векторам на основе pIJ101, поскольку они хорошо изучены и обладают высокой трансформирующей активностью. Эта плазмида Streptomyces обладает самой широкой хозяйской специфичностью и дает 40–300 копий на клетку. Плазмида pUC6 является криптической и выделена из клеток S. espinosus. Она
представлена в клетке 30–40 копиями, хотя получен ее делеционный вариант, имеющий до 600 копий (самый высококопийный вектор Streptomyces). Низкокопийные векторы имеют один существенный недостаток: сложность получения большого количества ДНК. Из таких плазмид у Streptomyces наиболее широко используют SLP1.2, представленную 4–5 копиями. Получены производные этой плазмиды, несущие селективные маркеры устойчивости к тиострептону и неомицину. Плазмида несет уникальные сайты для рестриктаз BamHI и PstI. Клонирование в этих сайтах приводит к экспрессии чувствительного к неомицину фенотипа.
Векторные системы, способные интегрировать крупные вставки (>100 т. п. н.), используются для создания геномной библиотеки эукариотических геномов. В отличие от библиотек с небольшими вставками, в такой библиотеке будет представлен весь генетический материал организма. Кроме того, в этом случае уменьшается число клонов, которые нужно поддерживать. Для клонирования фрагментов ДНК размером от 100 до 300 т. п. н. был сконструирован низкокопийный плазмидный вектор на основе бактериофага Р1, называемый искусственной хромосомой на основе фага Р1. Был создан также очень стабильный вектор, способный интегрировать вставки длиной от 150 до 300 т. п. н., на основе F плазмиды с селекционной системой lacZ’. Эта конструкция называется бактериальной искусственной хромосомой (ВАС, от bacterial artificial chromosomes).