Соотношение фенотипической и филогенетической систематики прокариот. Основные достижения в филогении прокариот.

Биологическая систематика, дисциплина, которая занимается построением систем живых организмов и вирусов – это один из самых динамичных разделов биологии. С самого своего возникновения системы предлагались, отвергались и пересматривались, и процесс разработки систем столь же бесконечен, как и само познание. Если у высоко организованных групп живого системы в последние десятилетия изменялись сравнительно мало, то у примитивных и простых организмов изменения были просто революционны.Долгое время в микробиологии господствовала фенотипическая систематика бактерий, основанная на сходстве по совокупности морфологических признаков. Как оказалось, такая система искусственна, как когда-то была искусственна. Роль филогенетической системы: предсказание физиолого-биохимических свойств мало- или неизученных микроорганизмов по их генотипическим признакам.Роль филогенетического подхода на основе молекулярных признаков в том, что он позволяет более точно оценить ранг таксонов (например, порядок, класс или отдел) и время их дивергенции от общего предка. В результате, как правило, количество высших таксонов по мере изучения бактериальной биоты (бактериобиоты) увеличивается. В отдельных случаях таксоны понижаются в ранге (см. упразднение отдела Thermomicrobia).Построение естественной, филогенетической системы, т.е. отражающей наиболее вероятный ход эволюции, стало возможным на основе генотипических (молекулярно-генетических) признаков. Эти признаки (в историческом порядке) таковы.

Первонач филогенетическая теория предполагала, что некоторые типы питания бактерии произошли единожды и каждый составляет одну монофилетическую линию. На самом деле, анаэробное дыхание, хемоавтотрофия и аэробное дыхание возникали несколько раз в независимых эволюционных линиях. Согласно гипотезе конверсии фототрофные бактерии возникли из бродильных бактерий, что согласуется с современными филогенетическими данными.Вопрос о количестве главных эволюционных линий бактерий остается открытым. Согласно наиболее новым данным, на «дереве жизни» выделяют (включая некультивируемые виды) более 40 филогенетических линий эубактерий и 12 или более линий архей.

Сложн филоген стр-ру имеют отд:Firmicutes, Actinobacteria, Proteobacteria, Bacteroidetes, Cyanobacteria. Кол-во родов бактерий по наиболее дробной классификации достигает около 1000. Из них для 80 родов до сих пор не установлено отчетливое филогенетическое родство. Многие из таких родов помещены в отдел Proteobacteria. Некот крупные роды филогенетически разнородны. К ним относятся Pseudomonas, Bacillus, Clostridiu