Определение терминов классификация и номенклатура. Филогенетическая систематика и кладистика.

Таксономические категории, применяемые для бактерий. Бинарная номенклатура.
Классификация – теория и процесс разделения организмов на группы по тем или иным признакам. При этом классификация может быть проведена по любым интересующим признакам, например, классам опасностей (патогенности) микроорганизмов, типам продуцируемых антибиотиков и т.п. В этом случае речь идет об искусственных классификациях.

Номенклатура – присвоение названий адекватного таксономического ранга тем или иным организмам.

Кладистика – одно из направлений систематики ‒ рассматривает последовательное обособление отдельных ветвей на эволюционном дереве. Отдельные теоретики считают, что кладистика неприменима к бактериям, т.к. у бактерий мало что известно о процессах конвергенции.

Филогения (филогенетическая систематика) – систематика, основанная на естественном ходе эволюции. Филогения рассматривает (реставрирует) ход, скорость и характер эволюции той или иной группы организмов, с учетом существования предковых таксонов. Т.е. организмы группируются согласно их эволюционной истории (генеалогии).

Сложную филогенетическую структуру имеют отделы: Firmicutes, Actinobacteria, Proteobacteria, Bacteroidetes, Cyanobacteria. Несколько недавно открытых отделов бактерий и архей определены на основе единственного вида.

Количество родов бактерий по наиболее дробной классификации достигает около 1000. Из них для 80 родов до сих пор не установлено отчетливое филогенетическое родство. Многие из таких родов помещены в отдел Proteobacteria. Некоторые крупные роды бактерий являются филогенетически разнородными. К ним относятся Pseudomonas, Bacillus, Clostridium.

БИНАРНАЯ номенклатура (биноминальная номенклатура) - обозначение видов животных, растений и микроорганизмов двумя латинскими словами: первое - название рода, второе - видовой эпитет (напр., Lepus europaeus - заяц-русак, Centaurea cyanus - василек синий). Предложена К. Баугином (1620), положена в основу систематики К. Линнеем (1753).