Важнейшие группы прокариот

Общие представления о прокариотах. Отличия прокариот от эукариот.

Роль физиологических и морфологических признаков в определении видов бактерий. Концепция вида у прокариот.

Соотношение фенотипической и филогенетической систематики прокариот. Основные достижения в филогении прокариот.

Молекулярно-генетические признаки в систематике: специфичность нуклеотидного состава, методы ее определения; ДНК-ДНК гибридизация; применение генетических зондов

Значение 16S РНК в систематике. Молекулярная гибридизация 16S РНК.

Молекулярно-генетические признаки в систематике: сиквенсы ДНК. Роль метагеномики.

Типы таксономических маркеров и их разрешающая способность в отношении таксонов бактерий разного уровня.

Определение терминов классификация и номенклатура. Филогенетическая систематика и кладистика.

Положение прокариот в системе органического мира (исторический очерк).

Основные фенотипические категории бактерий. Отличия эубактерий и архей. Дифференциирующие признаки основных категорий Gracilicutes и Firmicutes.

Путь идентификации бактерий по фенотипу. Признаки, используемые для определения бактерий до уровня фенотипической группы.

Физиологические группы бактерий. Примеры отделов, характеризующих физиологические группы.

Использование химического и ДНК-фингерпринтинга при дифференциации штаммов бактерий.

Количество видов прокариот: описанное и прогностическое.

Маркеры в хемотаксономии бактерий.

Группы признаков, используемых при описании видов

Истинная и ложная гомология в систематике. Семантиды в качестве филогенетических маркеров.

Этапы построение филогенетического дерева. Элементы филогенетического дерева.

Роль прокариот в эволюции биосферы

Краткая характеристика отдела Euryarchaeota.

Отдел Кренархеота - Crenarchaeota.

Отдел Корархеота – Korarchaeota (синоним: Xenarchaeota)

Отдел Наноархеота - Nanoarchaeota.

Отдел Таумархеота - Thaumarchaeota.

Отдел Термотоги – Thermotogae.

Отдел Синергисты – Synergistetes (Synergistes).

Отдел Фирмикуты – Firmicutes.

Фузобактерии (Fusobacterium)

Отдел Нитроспиры – Nitrospira (Nitrospirae).

Цианобактерии (Cyanobacteria)

Краткая характеристика отделов Gemmatimonadetes, Fibrobacteres, Spirochaetes.

Отдел Фибробактерии – Fibrobacteres.

Отдел Спирохеты – Spirochaetes (Spirochaetae).

Краткая характеристика отделов планктобактерий: Planctomycetes, Chlamydiae, Lentisphaerae, Verrucomicrobia.

Отдел Хлоробы – Chlorobi

Отдел Хризиогенеты – Chrysiogenetes.

Отдел Протеобактерии – Proteobacteria.