Рациональная или систематическая классификация и номенклатура ферментов были разработаны Международной комиссией по ферментам и утверждены V биохимическим конгрессом в 1961 г. В основу классификации был положен главный признак - тип катализируемой реакции. В соответствии с этим признаком все ферменты разделили на шесть классов.
1. Оксидоредуктазы - катализируют окислительно-восстановительные реакции.
2. Трансферазы - катализируют реакции переноса группировок с одного соединения на другое.
3. Гидролазы- катализируют гидролитическое расщепление веществ.
4. Лиазы- катализируют реакции негидролитического расщепления с образованием двойных связей или реакции присоединения по двойным связям (синтазы).
5. Изомеразы- катализируют реакции изомеризации соединений.
6. Лигазы (синтетазы)- ускоряют реакции синтеза с использованием энергии макроэргических соединений.
Классы поделили на подклассы, подклассы - на группы. Разработанная научная система классификации позволила комиссии составить список ферментов (Номенклатура ферментов, I961) с присвоением каждому шифр состоящий из четырех чисел : первое число -класс, второе - подкласс, третье - группа и четвертое - порядковый № фермента в данной группе. Перед шифром ставят буквы КФ (Классификация ферментов). В списке, помимо шифра, приводятся систематическое название, рекомендуемое рабочее название, химическая реакция, катализируемая ферментом, а также замечания о специфичности действия, строении и пр.
Комиссия, для образования названий конкретных ферментов, рекомендовала использование двух номенклатур: систематической и рабочей.
Систематическое название фермента включает название (-ия) субстрата (-ов,) тип катализируемой реакции, и точно указывает действие фермента:
1 класс - донор водорода или электронов : акцептор оксидоредуктаза.
2 класс - донор:акцептор- транспортируемая группа трансфераза.
3 класс - из названия субстрата - гидролаза.
4 класс - из названия субстрата, отщепляемой группы- лиаза.
5 класс - субстрат - тип реакции изомеризации - изомераза.
6 класс - А:В лигаза (образующая АДФ), где А и В - соединяющиеся субстраты, в скобках - остаток нуклеозидтрифосфата, который был источником энергии.
Систематическое название с шифром, используют.в научных публикациях при первом упоминании фермента с обязательным указанием биологического источника, в последующем тексте разрешается пользоваться рабочим (более коротким и привычным) названием. Комиссия сохранила сложившиеся рабочие названия ферментов и рекомендовала упорядочить их образование по схеме:
I. Название всех (кроме гидролаз) ферментов образуется из названия субстрата (или продукта), типа катализируемой реакции и окончания -аза.
Фермент, катализирующий отнятие оксида углерода от субстрата, называют декарбоксилаза, отнятие аминогруппы - дезаминаза, отнятие воды - дегидратаза. Фермент, катализирующий присоединение к субстрату оксида углерода, называют карбоксилаза и т.д.
2. Название гидролаз образуется из названия субстрата с окончанием -аза. Примеры: белок - протеин - протениаза, пептид - пептидаза, крахмал - амилюм - амилаза и т.д.
3. Сохранить старые названия протеолитических ферментов с окончанием -ин: пепсин, трипсин, химозин, катепсин, папаин и др.
Когда субстратом является органическая кислота, в названии фермента указывается название ее аниона с окончанием -ат: ацетат, пируват, лактат, цитрат, аспартат, глутамат, аденилат и т.д.
В названиях соединений, в которых группа –СН2 - заменена группой -СО, следует употреблять префикс оксо, например, 2-оксоглутарат; префикс кето применяется для производных сахаров.
Для наименования нескольких (более одного) структурно и функционально связанных ферментов (и кофакторов), должно быть включено слово "система" с названием катализируемой ею суммарной реакции или процесса. Примерами может быть пируватдегидрогеназная система, система синтетазы жирных кислот, цитохромная система, сукцинатоксидазная система, (состоящая из сукцинатдегидрогеназы, цитохромоксидазы и нескольких промежуточных переносчиков) окисляющая янтарную кислоту молекулярным кислородом.
Поможем написать любую работу на аналогичную тему